Marc Marquez, qualifié en pole position du GP de République tchèque 2017, a conservé le haut de la feuille de temps ce dimanche matin alors que la pluie a comme prévu fait son retour à Brno. Le tenant du titre, très à l'aise sur ce circuit sur lequel le HRC a mené des tests privés cet été, termine cette ultime séance avec 1,040 sec d'avance sur la Ducati de Scott Redding et 1,328 sec sur celle d'Andrea Dovizioso.

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Sam Lowes s'illustre sur l'Aprilia avec la 4ème place devant la Ducati au nouveau carénage de Jorge Lorenzo et la RC213V de Dani Pedrosa. Valentino Rossi, deuxième sur la grille, signe le 9ème temps de ce warm-up, tandis que son coéquipier Viñales finit 13ème. L'espagnol, peu à l'aise sur le mouillé, continue à déplorer les difficultés rencontrées pour faire tourner sa M1 ainsi que son instabilité sur l'angle, visible depuis le bord de piste. Zarco est 15ème.